مقاله آماری خوشه‌بندی پروفایل‌های طولی با مدل‌های اثرات آمیخته ناپارامتری و نیمه‌پارامتری

مقاله آماری خوشه‌بندی پروفایل‌های طولی با مدل‌های اثرات آمیخته ناپارامتری و نیمه‌پارامتری

چکیده مقاله آماری خوشه‌بندی پروفایل‌های طولی :

روش‌های متعددی برای خوشه‌بندی داده‌های بیان ژن دوره‌ای زمانی وجود دارد ولی محدودیت‌هایی برای این روش‌ها وجود دارد که از جمله‌ آن‌ها می‌توان به عدم در نظر گرفتن همبستگی در طول زمان و زمان‌بر بودن محاسبات اشاره داشت. در این مقاله با معرفی مدل‌های اثرات آمیخته‌ی ناپارامتری و نیمه‌پارامتری، این همبستگی در طول زمان در نظر گرفته شده و با استفاده از اسپلاین تاوانیده، حجم محاسبات به طور چشم‌گیری کاهش یافته است. در پایان با استفاده از مطالعه‌ شبیه‌سازی عملکرد روش پیشنهادی با روش‌های قبلی مقایسه و با استفاده از ملاک BIC، مدل مناسب‌تر انتخاب و تحلیل می‌شود. همچنین روش پیشنهادی در یک مثال کاربردی داده‌های بیان ژن دوره‌ای زمانی ارائه شده است.

Abstract of longitudinal profile clustering statistical article

There are several methods for clustering time expression gene expression data, but there are limitations to these methods, including the lack of correlation over time and the time consuming computations. In this paper, by introducing non-parametric and semi-parametric mixed effects models, this correlation has been considered over time and the volume of calculations has been significantly reduced by using a spline. Finally, using a performance simulation study, the proposed method is compared with previous methods and a more appropriate model is selected and analyzed using the BIC criterion. The proposed method is also presented in a practical example of time period gene expression data.

نویسندگان

• میثم تسلی زاده خمس
• زهرا رضایی قهرودی

منبع: http://jss.irstat.ir

برای دانلود مقاله خوشه‌بندی پروفایل‌های طولی که به صورت رایگان در اختیار شما پژوهشگر عزیز قرار میگیرد ابتدا به سبد خرید اضافه کنید و سپس مقاله را دانلود نمایید.